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蛋白質易位屬于什么功能,生物脅迫又屬于什么功能?

蛋白質從核糖體進入內(nèi)質網(wǎng)的方式是什么

是通過共翻譯時易位的方式使這些蛋白質轉運到內(nèi)質網(wǎng)膜上。 蛋白質的易位分為兩步,首先帶有新生肽鏈的核糖體結合到膜上,然后新生肽鏈進入通道并進行易位。核糖體與膜的結合需要信號識別顆粒SRP,因為SRP有兩個功能:能結合新合成分泌蛋白質的信號序列,還可以結合膜上的信號識別受體。因此,當SRP與膜上受體結合后,核糖體結合到膜上,信號肽帶著蛋白質便通過孔道進入了內(nèi)質網(wǎng)中。

木霉的蛋白質分泌途徑

蛋白質的多肽鏈在細胞質中合成并在內(nèi)質網(wǎng)膜易位進入分泌途徑。在真核生物中有兩種類型的蛋白易位過程,即共翻譯轉運和翻譯后轉運,前者在哺乳動物細胞中比較常見,而這兩種類型共存于釀酒酵母中;絲狀真菌中新生多肽的易位主要采用共翻譯轉運方式。

多肽進入內(nèi)質網(wǎng)后,在一系列折疊酶和伴侶蛋白協(xié)助下進行蛋白的正確折疊并裝配成寡聚體,同時新合成的多肽被糖基化,核心N-聚糖結合于內(nèi)質網(wǎng)膜上寡糖轉移酶復合體的一個Asn殘基上。蛋白質在內(nèi)質網(wǎng)與高爾基體之間的運輸是由轉運包被小泡介導的。有COPⅠ和COPⅡ兩種類型包被小泡。COPⅡ包被小泡將初步成熟的蛋白質從內(nèi)質網(wǎng)運輸?shù)礁郀柣w,在COPⅠ包被小泡的幫助下蛋白質穿過高爾基體被運送到反面,同時錯誤折疊的蛋白也會通過COPⅡ小泡被重新運回內(nèi)質網(wǎng)進行重新折疊。T.reesei的基因sarT,是編碼參與蛋白質從內(nèi)質網(wǎng)到高爾基體運輸過程的蛋白質之一,編碼的蛋白質較小,是一種GTP-結合蛋白。來自木霉的該基因編碼序列,與酵母sar1基因有72%的同源性,而與曲霉SAR1蛋白有86%的相似性,說明木霉中存在分泌型小泡(Punt et al.,1996;Saloheimo et al.,1996;Kurzatkowski et al.,1996)。

初步成熟的蛋白質轉運到高爾基體后,繼續(xù)進行翻譯后修飾,例如N-連接的糖基化修飾,O-連接的糖基化修飾和磷酸化等過程。通過超微結構研究,發(fā)現(xiàn)在木霉中存在高爾基體(Ghosh et al.,1990;Kurzatkowski et al.,1996),通過生物化學手段,在其他生物中展示了典型的高爾基體相關酶活性,例如Kex2 蛋白酶(Goller et al.,1997),O-甘露糖基化最后一步反應的發(fā)生(Kruszewska et al.,1989),真菌分泌型蛋白中前體氨基酸序列中的Kex2型蛋白質裂解目標物,這些都確認在木霉中存在高爾基體。在T.reesei中,分泌型蛋白的Kex2-型裂解很重要,如果抑制Kex2 p活性,將導致分泌蛋白的減少,并且非裂解的蛋白在胞內(nèi)同時發(fā)生積累現(xiàn)象(Goller et al.,1997)。最后,通過高爾基體腔體以后,分泌小泡將蛋白質運送到不同的目標位置,例如液泡、細胞質膜、內(nèi)吞體等細胞器,在木霉菌絲生長的頂端,小泡與細胞質膜融合,將分泌蛋白釋放到周質空間(Valkonen et al.,2003)。

過量表達的外源蛋白超出細胞的承受能力,多肽鏈不能及時正確折疊,從而在內(nèi)質網(wǎng)內(nèi)形成錯誤折疊或未折疊的蛋白質積累,會嚴重影響蛋白的轉運和分泌,這是造成外源蛋白產(chǎn)量低的一個重要因素。在表達系統(tǒng)中,轉移到內(nèi)質網(wǎng)的大流量蛋白對蛋白折疊、轉運及合成蛋白的質量控制提出了更高要求。

蛋白通過細胞內(nèi)膜系統(tǒng)的蛋白分泌途徑被分泌到細胞表面,分泌蛋白隨同細胞內(nèi)其他位置比如質膜、液泡或高爾基復合體的蛋白一起通過內(nèi)膜系統(tǒng)轉運(Conesa et al.,2001;Spang,2008;Shoji et al.,2008;Sallese et al.,2009;Hutagalung et al.,2011)。

蛋白質由N-端的信號序列引導進入分泌途徑。在共翻譯轉運中,信號識別顆粒(SRP)識別新生的轉運信號序列,翻譯終止。SRP指導核糖體-mRNA-多肽三元復合體易位到內(nèi)質網(wǎng)膜上。這個復合體由多個蛋白質(包括SEC61)形成一個通道,穿過內(nèi)質網(wǎng)膜。蛋白邊轉錄邊易位,分泌蛋白向內(nèi)質網(wǎng)腔轉移的同時,進行翻譯后修飾。在胞質中通過SEC62-SEC72-SEC73亞復合體介導進行翻譯后修飾活動,同時多肽通過SEC61通道進入內(nèi)質網(wǎng)腔。

在蛋白質分泌途徑中,內(nèi)質網(wǎng)的重要作用是進行蛋白折疊,使蛋白形成正確的構象,在這個過程中有伴侶分子和折疊酶參與,分子伴侶是一類在序列上沒有相關性但有共同功能的蛋白質,它們在細胞內(nèi)幫助其他含多肽的結構完成正確的組裝,而且在組裝完畢后與之分離,不構成這些蛋白質結構執(zhí)行功能時的組分。分子伴侶主要分為伴侶素家族(Chaperonin,Cpn),應激蛋白70家族(Stress-70 Family),應激蛋白90家族(Stress-90 Family)。內(nèi)質網(wǎng)伴侶分子主要是HSP70家族的成員,該家族成員主要以ATP依賴的方式結合未折疊多肽鏈的疏水區(qū)以穩(wěn)定蛋白質的未折疊狀態(tài),再通過有控制的釋放幫助其折疊,參與受損蛋白降解(Parsell et al.,1993),具有耐熱性(Sung et al.,2001;Montero-Barrientos et al.,2007,2008)。其中最重要的是BiP(綁定蛋白)。內(nèi)質網(wǎng)氧化還原傳輸系統(tǒng)催化形成分泌蛋白的二硫鍵。另外,分子伴侶hsp70 基因也屬于應激蛋白70 家族,是一類分子量約70 KD的高度保守的ATP酶,其功能是提高蛋白對熱激和非生物脅迫的耐性(Miersch et al.,2008;Montero-Barrientos et al.,2008),它被稱為“細胞溫度計”,作為熱效應響應的負調節(jié)器(Kregel,2002)。Montero-Barrientos 分離到哈茨木霉(T.harzianum)T34 hsp70基因,并通過同源過表達分析其功能,發(fā)現(xiàn)其具有耐熱性,并能交叉耐受滲透、鹽和氧化壓力(Montero-Barrientos et al.,2008)。折疊酶屬于蛋白二硫化物異構酶家族(PDI)或ERV1家族,通過巰基氧化酶使蛋白正確折疊。脯氨酸順反異構酶(PPI)是參與蛋白折疊的另外一個折疊酶家族重要成員。

新生的分泌蛋白在轉運和折疊過程中被糖基化。通過內(nèi)質網(wǎng)膜上的寡糖轉移酶使核心N-聚糖與天冬酰胺殘基相連。內(nèi)質網(wǎng)有一套完善的質量控制系統(tǒng),監(jiān)督蛋白的折疊狀態(tài),只允許完全正確折疊的蛋白被轉運出內(nèi)質網(wǎng)。錯誤折疊蛋白或聚集一起的蛋白均被轉移出內(nèi)質網(wǎng),并被內(nèi)質網(wǎng)上的蛋白降解系統(tǒng)降解(ERAD,Bernasconi et al.,2011)。

分泌蛋白經(jīng)過折疊與糖基化后才能被分泌到細胞外。這個過程有兩個轉運小泡參與,首先蛋白從內(nèi)質網(wǎng)轉運到高爾基體,再從高爾基體轉運到質膜。在這兩個過程中,分泌蛋白通過特異蛋白包被被包裹進膜小泡涂層中,這些小泡再隨著細胞相關活動被轉運到它們的目的地,最終,小泡與靶標膜融合,將分泌蛋白釋放到高爾基體或質膜外(Spang,2008)。這些小泡的形成、轉運、融合過程是由一種蛋白復合體控制的,這種復合體的數(shù)量很多。有一部分蛋白參與全部膜的融合分泌活動——通用融合因子,例如 SEC17和SEC18/NSF蛋白,其余蛋白只是參與某一個步驟,比如SAR1/ARF1型小G蛋白參與小泡分化,Rab 類型小 G 蛋白參與小泡融合(Hutagalung et al.,2011),v-SNARE-和t-SNARE-蛋白分別位于小泡和靶標膜上。SNARE蛋白在小泡到達靶標膜時能互相識別并綁定在一起,能使小泡和靶標膜特異地融合(Malsam et al.,2008;Kienle et al.,2009)。一些大型蛋白復合體(外囊)在小泡與靶標膜融合體在質膜的定位過程中,起到了重要作用,這些蛋白復合體包括 SEC3,SEC5,SEC6,SEC8,SEC10和SEC15(He et al.,2009)。

里氏木霉(T.reesei)是一種嗜溫腐生性絲狀真菌,具有很好的合成和分泌蛋白的能力,同時具有真核特點的蛋白分泌機制與系統(tǒng),該機制、系統(tǒng)與哺乳動物的相似,例如高甘露糖型和N-糖基化。對黑曲霉(Aspergillus niger)和里氏木霉(T.reesei)進行的超微結構觀察表明,真菌的蛋白分泌途徑遵循酵母和高等植物的基本原則(Hemming,1995)(圖11.1)。通過轉運機制,欲分泌的蛋白質被引向內(nèi)質網(wǎng)。蛋白分泌過程有信號肽的參與,所有分泌型真菌蛋白質在其N-端附近包含裂解肽;關于木霉分泌性蛋白信號肽情況見表11.1。內(nèi)質網(wǎng)膜上嵌有負責長醇依賴型蛋白質糖基化的酶,而在內(nèi)質網(wǎng)腔中則含有負責蛋白質折疊的酶,例如二硫鍵異構酶(PDI),肽基脯氨酰異構酶(PPI),或者分子伴侶例如BIP或者它們的酵母類似物(Kar2蛋白)。分泌蛋白向內(nèi)質網(wǎng)腔轉移的同時,信號序列丟失,然后進行翻譯后修飾,例如O-和N-連接的糖基化,形成二硫鍵,結構重排以便折疊正確等;有些基因編碼折疊酶,或者具有其他酶功能的蛋白,例如O-甘露糖基化,這些現(xiàn)象都在木霉中存在。

圖11.1 絲狀真菌蛋白分泌示意

T.reesei中蛋白分泌涉及的基因有:hac1,編碼UPR轉錄因子;ire1,編碼UPR響應因子;ptc2,編碼UPR負調控因子的磷酸鹽(phosphatase acting as a negative regulator of UPR);sec61,編碼內(nèi)質網(wǎng)膜上蛋白轉運體系中的主要組件;pdi1,蛋白質二硫化物異構酶;bip1,lhs1,編碼內(nèi)質網(wǎng)中蛋白折疊相關蛋白-伴侶分子HSP70蛋白家族;sar1,編碼從內(nèi)質網(wǎng)向外分泌小泡過程涉及的小G蛋白;ypt1,編碼小泡轉運進高爾基體涉及的ras型小G蛋白;nsf1,編碼小泡融合過程中涉及的通用融合因子;snc1,編碼小泡融合到質膜過程中涉及的v-SNARE蛋白;sso1/2,編碼小泡融合到質膜過程中涉及的t-SNARE;ftt1/2,編碼蛋白分泌途徑中最后步驟涉及的14-3-3型蛋白;rho3,編碼細胞極性和小泡與質膜融合涉及的ras型小G蛋白

(Saloheimo et al.,2012)

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