ncbi基因所處的基因組位置怎么查看
- 教育綜合
- 2023-07-05 07:57:16
求教怎么看NCBI的基因圖
NC表示人類基因組DNA的RefSeq。(鏈接序列) NM表示mRNA的RefSeq。 NP表示蛋白質(zhì)的RefSeq 查找基因的基本信息的方法如下: 根據(jù)文獻(xiàn)中已知的基因ID如果你在文獻(xiàn)中看到你感興趣的基因,而且文中還提到了 基因在Genbank中的ID號(hào),那就好辦了,直接打開http://www.ncbi.nlm.nih.gov ,在Search后的下拉框中選擇Nucleotide,把Genbank ID號(hào)輸入GO前面的文本框中,點(diǎn)“GO”,就可以找到了。(如GenBank accession number gi 16151096)”。 2. 根據(jù)已經(jīng)獲得的基因的相關(guān)信息進(jìn)行查找,打開htt怎么從NCBI上查某個(gè)基因序列?
1、打開NCBI
百度搜索鍵入“NCBI”,點(diǎn)擊“搜索”,第一個(gè)就是官方主頁,點(diǎn)擊打開。
2、關(guān)鍵字查找
以H9亞型流感病毒HA基因下載為例,說明詳細(xì)過程。
既然要下載基因序列,需要在欄目內(nèi)找到“Nucleotide”(核苷酸),搜索欄內(nèi)填入“Avian influenza virus H9 HA”,點(diǎn)擊“search”。
3、添加限定詞
點(diǎn)擊搜索后,我們看到頁面中間顯示了很多關(guān)于“Avian influenza virus H9 HA”的基因序列,如果其中的一個(gè)符合你的要求,就可以下載。
如何不符合的要求,可以繼續(xù)在搜索條內(nèi)添加限定,比如添加“2010”,即2010年分離到的病毒。
3、序列選定
找到目標(biāo)基因序列后,我們要將其下載下來。以給出第一個(gè)序列為例,點(diǎn)擊序列前面的“小方格”,將其選定。
4、下載序列
選定后,點(diǎn)擊頁面右上角的“Send to”,選擇“file”,再將format選擇為“FASTA”格式,點(diǎn)擊“Create file”,將序列下載到自定的文件夾內(nèi)。
5、用DNAStar打開
下載的序列為FASTA格式,需要使用相關(guān)的軟件打開,小編經(jīng)常使用的是DNAStar中的Editseq,這個(gè)功能還是很強(qiáng)大的。
怎樣在NCBI中查找基因
找?guī)讉€(gè)近源的物種的該基因clustal,找出幾個(gè)長度大于20的保守區(qū),在這幾個(gè)保守區(qū)域拉幾條引物,放到primer5里評(píng)一下分,找一對(duì)分?jǐn)?shù)高的引物,產(chǎn)物長度200-1000bp都可以,擴(kuò)去就行了。如果找不到完全一致的引物,就在不一樣的那個(gè)堿基上設(shè)計(jì)成簡并的。 如果知道要找的基因的名字是可以很快的找到要找的序列,在基因名稱檢索界面輸入就好。 因?yàn)樘峤籒CBI上的基因組都有預(yù)測CDS的,上面都標(biāo)出每個(gè)CDS的可能功能及相應(yīng)蛋白或酶的名字 如果不知道基因名字,可以通過做比對(duì)來判斷,可以嘗試一下用BIOED如何在NCBI上查找某個(gè)基因在染色體的位置,例如顯示出在第幾號(hào)染色體。。基因序列什么的都清楚,就是不...
在NCBI網(wǎng)站,選擇OMIM(PUBMED下面),輸入基因名稱,你會(huì)獲得許多關(guān)于該基因的信息,其中就包括染色體定位。怎么在ncbi查找犬類的全基因組
網(wǎng)頁鏈接
在ncbi頁面搜索,左邊選擇genome, 右邊輸入你的物種名,搜索,會(huì)出現(xiàn)一個(gè)頁面,上面顯示相關(guān)物種的進(jìn)化樹,點(diǎn)開你需要的物種名,出現(xiàn)相關(guān)信息,點(diǎn)擊其在ncbi的序列號(hào),就可以看到基因組信息了,前提是有這個(gè)物種的全基因組信息。
詳細(xì)如下圖
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求大佬幫忙,在線等,感激不盡
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