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高通量PCR的檢測(cè)步驟有哪些。

pcr實(shí)驗(yàn)步驟

pcr實(shí)驗(yàn)步驟如下:

1.初始化步驟。這僅對(duì)熱啟動(dòng)PCR必不可少。此步驟將溶液加熱至94-98°C,以激活DNA聚合酶。該步驟的時(shí)間取決于所使用的聚合酶。

2.變性步驟。DNA是雙鏈分子,DNA擴(kuò)增需要引物與單鏈DNA模板相互作用。在此步驟中,將反應(yīng)混合物加熱至94-98°C并保持20-30秒,以破壞兩條鏈之間的氫鍵并生成單鏈DNA分子。此時(shí)進(jìn)入PCR循環(huán)。

3.退火步驟。變性后,反應(yīng)混合物中的DNA模板是單鏈的。由于引物與DNA模板互補(bǔ),當(dāng)反應(yīng)溫度降低到50-65℃時(shí),引物會(huì)與模板序列匹配,互補(bǔ)堿基之間形成氫鍵。退火溫度取決于所用引物的Tm,一般比引物Tm低3-5℃左右。該步驟將持續(xù)約20-40秒以完全退火,然后聚合酶將定位到引物-模板雜交體以開始DNA組裝。

4.伸長(zhǎng)步驟。在此步驟中,DNA聚合酶開始合成DNA,因此溫度應(yīng)為DNA聚合酶的最適溫度。一般選擇72°C,但有些酶在68°C時(shí)效果更好。

這一步與體內(nèi)DNA復(fù)制非常相似,DNA聚合酶將dNTPs添加到引物中,以5'到3'方向與模板互補(bǔ),最終產(chǎn)生新的雙鏈DNA片段。延伸時(shí)間取決于目標(biāo)DNA片段的長(zhǎng)度和DNA聚合酶的能力。一般來(lái)說(shuō),DNA聚合酶每60秒產(chǎn)生一千個(gè)堿基。

5.2~4步稱為一個(gè)循環(huán),每循環(huán)一次,目標(biāo)片段量翻倍。一個(gè)PCR過(guò)程使用30-35個(gè)循環(huán)。在PCR循環(huán)的早期,PCR產(chǎn)物以指數(shù)速率積累,而在PCR循環(huán)的后期,隨著dNTPs、引物的減少和DNA聚合酶在變性溫度下的失活,反應(yīng)減慢,PCR速率逐漸下降。

6.最終伸長(zhǎng)率。30-35個(gè)循環(huán)結(jié)束后,在68-74℃的溫度下最終延伸約5-10分鐘,以充分延伸剩余的單鏈DNA。

7.貯存。最終產(chǎn)品可以在PCR機(jī)器中維持溫度在4-10°C。

高通量測(cè)序的步驟?

當(dāng)然,首先地提取出您想要測(cè)序的東西,比如RNA、DNA 。再就是建庫(kù)-測(cè)序-分析。建庫(kù)需要將序列片段化、加接頭、PCR。不同的業(yè)務(wù)有細(xì)微的差別,比如RNA要先反轉(zhuǎn)錄成cDNA等等。然后就是上機(jī)測(cè)序了!最后就是數(shù)據(jù)分析了。數(shù)據(jù)分析分為流程分析(基本分析)和個(gè)性分析(根據(jù)老師課題分析)。這些以后呢,就是利用數(shù)據(jù)寫進(jìn)文章準(zhǔn)備發(fā)文章吧!

PCR的完整操作步驟是什么?

首先在PCR儀中設(shè)定程序:一般是94度變性5min,之后“94度變性、退火(不同引物溫度不同)、72度”延伸共30-35個(gè)循環(huán),再72度延伸10min,最后hold16度即可。反應(yīng)體系一般有20微升或50微升,由上下游引物、buffer、dNTP、模板、Taq酶和水等組成,配好后放入PCR儀中按設(shè)定程序進(jìn)行即可。

pcr的技術(shù)的主要步驟及pcr引物設(shè)計(jì)的一般原則有哪些

PCR的技術(shù)的主要步驟及PCR引物設(shè)計(jì)的一般原則分述如下:

PCR的技術(shù)的主要步驟:

1、DNA變性:(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈DNA。

2、退火:(60℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。

3、延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dNTP為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,合成與模板互補(bǔ)的DNA鏈。

每一循環(huán)經(jīng)過(guò)變性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍?,F(xiàn)在有些PCR因?yàn)閿U(kuò)增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是最佳也能在很短的時(shí)間內(nèi)復(fù)制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時(shí)在60℃-65℃間進(jìn)行,以減少一次升降溫過(guò)程,提高了反應(yīng)速度。

2、引物設(shè)計(jì)的基本原則

1、引物長(zhǎng)度:15-30bp,常用為20bp左右。

2、引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C 過(guò)多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC最好隨機(jī)分布,避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。

3、引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補(bǔ)序列。

4、兩個(gè)引物之間不應(yīng)存在互補(bǔ)序列,尤其是避免3 ′端的互補(bǔ)重疊。

5、引物與非特異擴(kuò)增區(qū)的序列的同源性不要超過(guò)70%,引物3′末端連續(xù)8個(gè)堿基在待擴(kuò)增區(qū)以外不能有完全互補(bǔ)序列,否則易導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。

6、引物3‘端的堿基,特別是最末及倒數(shù)第二個(gè)堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對(duì),最佳選擇是G和C。

7、引物的5 ′端可以修飾。如附加限制酶位點(diǎn),引入突變位點(diǎn),用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標(biāo)記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。

擴(kuò)展資料

PCR技術(shù)的基本原理 類似于DNA的 天然復(fù)制過(guò)程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物。

PCR是一種體外DNA 擴(kuò)增技術(shù),是在模板DNA、引物和4種脫氧核苷酸存在的條件下,依賴于DNA聚合酶的酶促合反應(yīng),將待擴(kuò)增的DNA片段與其兩側(cè)互補(bǔ)的寡核苷酸鏈引物經(jīng)“高溫變性——低溫退火——引物延伸”三步反應(yīng)的多次循環(huán),使DNA片段在數(shù)量上呈指數(shù)增加,從而在短時(shí)間內(nèi)獲得我們所需的大量的特定基因片段。

在環(huán)境檢測(cè)中,靶核酸序列往往存在于—個(gè)復(fù)雜的混合物如細(xì)胞提取液中,且含量很低,對(duì)于探測(cè)這種復(fù)雜群體中的特異微生物或某個(gè)基因,雜交就顯得不敏感。使用PCR技術(shù)可將靶序列放大幾個(gè)數(shù)量級(jí),再用探針雜交探測(cè)對(duì)被擴(kuò)增序列作定性或定量研究分析微生物群體結(jié)構(gòu)。PCR技術(shù)常與其他技術(shù)結(jié)合起來(lái)使用, 如RT-PCR、競(jìng)爭(zhēng)PCR、巢式PCR、RAPf)、ARDRA等。

第一代PCR就是常見的定性PCR技術(shù),它采用普通PCR儀來(lái)對(duì)靶基因進(jìn)行擴(kuò)增,采用瓊脂糖凝膠電泳來(lái)對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行分析。第二代PCR就是熒光定量PCR技術(shù)(Real-Time PCR,qPCR),它通過(guò)在反應(yīng)體系中加入能指示反應(yīng)進(jìn)程的熒光試劑來(lái)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物的積累,借助熒光曲線的Cq值來(lái)定量起始靶基因的濃度。

第三代PCR技術(shù)--數(shù)字PCR(Digital PCR,dPCR,Dig-PCR),是一種全新的對(duì)核酸進(jìn)行檢測(cè)和定量的方法。它采用直接計(jì)數(shù)目標(biāo)分子而不再依賴任何校準(zhǔn)物或外標(biāo),即可確定低至單拷貝的待檢靶分子的絕對(duì)數(shù)目。

PCR芯片技術(shù)PCR儀器發(fā)展的趨勢(shì)之一變得更加微型化,PCR芯片就是在這種趨勢(shì)下誕生的。PCR芯片就是在微型的載體上進(jìn)行PCR反應(yīng),是微型化的PCR儀。芯片PCR不僅節(jié)省了大量反應(yīng)試劑因此降低了實(shí)驗(yàn)成本,還有助于提高反應(yīng)速度。

參考資料:百度百科-PCR技術(shù)

PCR實(shí)驗(yàn)原理和操作步驟是什么?

實(shí)驗(yàn)方法原理

①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至94℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)做準(zhǔn)備;

②模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合;

③引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在Taq酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對(duì)與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈。

重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過(guò)程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán)需2~4分鐘, 2~3小時(shí)就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬(wàn)倍。

典型的PCR包括高溫變性、低溫退火、中溫延伸三個(gè)步驟,通過(guò)將這一套過(guò)程不斷循環(huán),使DNA得以成百萬(wàn)倍的擴(kuò)增。


擴(kuò)展資料

PCR技術(shù),即聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)是由美國(guó)PE Cetus公司的Kary Mullis在1983年(1993年獲諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng))建立的。

這項(xiàng)技術(shù)可在試管內(nèi)的經(jīng)數(shù)小時(shí)反應(yīng)就將特定的DNA片段擴(kuò)增數(shù)百萬(wàn)倍,這種迅速獲取大量單一核酸片段的技術(shù)在分子生物學(xué)研究中具有舉足輕重的意義,極大地推動(dòng)了生命科學(xué)的研究進(jìn)展。

它不僅是DNA分析最常用的技術(shù),而且在DNA重組與表達(dá)、基因結(jié)構(gòu)分析和功能檢測(cè)中具有重要的應(yīng)用價(jià)值。

PCR可以被認(rèn)為是與發(fā)生在細(xì)胞內(nèi)的DNA復(fù)制過(guò)程相似的技術(shù),其結(jié)果都是以原來(lái)的DNA為模板產(chǎn)生新的互補(bǔ)DNA片段。細(xì)胞中DNA的復(fù)制是一個(gè)非常復(fù)雜的過(guò)程。參與復(fù)制的有多種因素。PCR是在試管中進(jìn)行的DNA復(fù)制反應(yīng),基本原理與細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制相似,但反應(yīng)體系相對(duì)較簡(jiǎn)單。

PCR由變性--退火--延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至94℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)做準(zhǔn)備;

②模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合;

③引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在Taq酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對(duì)與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈。

重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過(guò)程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán)需2~4分鐘, 2~3小時(shí)就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬(wàn)倍。

參考資料來(lái)源:百度百科-pcr擴(kuò)增

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