請教一下，如果比較序列有<=4個(gè)因素，而參考序列的k=1，可以用灰色關(guān)聯(lián)分析法來對因素進(jìn)行關(guān)聯(lián)度排序嗎

灰色關(guān)聯(lián)分析理論及方法對于兩個(gè)系統(tǒng)之間的因素，其隨時(shí)間或不同對象而變化的關(guān)聯(lián)性大小的量度，稱為關(guān)聯(lián)度。在系統(tǒng)發(fā)展過程中，若兩個(gè)因素變化的趨勢具有一致性，即同步變化程度較高，即可謂二者關(guān)聯(lián)程度較高；反之，則較低。因此，灰色關(guān)聯(lián)分析方法，是根據(jù)因素之間發(fā)展趨勢的相似或相異程度，亦即“灰色關(guān)聯(lián)度”，作為衡量因素間關(guān)聯(lián)程度的一種方法[16]?；疑到y(tǒng)理論提出了對各子系統(tǒng)進(jìn)行灰色關(guān)聯(lián)度分析的概念，意圖透過一定的方法，去尋求系統(tǒng)中各子系統(tǒng)（或因素）之間的數(shù)值關(guān)系。因此，灰色關(guān)聯(lián)度分析對于一個(gè)系統(tǒng)發(fā)展變化態(tài)勢提供了量化的度量，非常適合動態(tài)歷程分析。灰色系統(tǒng)關(guān)聯(lián)分析的具體計(jì)算步驟如下[17]：（1）確定反映系

Python 比較序列和其它類型的使用與方法？

5.8. 比較序列和其它類型 序列對象可以與相同類型的其它對象比較。比較操作按 字典序 進(jìn)行：首先比較前兩個(gè)元素，如果不同，就決定了比較的結(jié)果；如果相同，就比較后兩個(gè)元素，依次類推，直到所有序列都完成比較。如果兩個(gè)元素本身就是同樣類 型的序列，就遞歸字典序比較。如果兩個(gè)序列的所有子項(xiàng)都相等，就認(rèn)為序列相等。如果一個(gè)序列是另一個(gè)序列的初始子序列，較短的一個(gè)序列就小于另一個(gè)。字符 串的字典序按照單字符的 ASCII 順序。 需要注意的是如果通過 < 或者 > 比較的對象只要具有合適的比較方法就是合法的。比如，混合數(shù)值類型是通過它們的數(shù)值進(jìn)行比較的，所以 0 是等于 0.0 。否則解釋器將會觸發(fā)一個(gè)

怎么利用bioedit做序列的比較

1、網(wǎng)絡(luò)搜索下載并安裝BioEdit軟件。

2、將你所要比對的序列以fasta格式粘貼在文本文檔里。

3、BioEdit軟件打開文本文檔，選中所有的序列，按下圖方法選擇要打開的標(biāo)簽。

4、在新的窗口中，按下圖所示勾選Note下面的方框（勾選之后可以在比對的結(jié)果中用星星表示，方便你看出哪些地方不一致）和運(yùn)行“RunClustalW”。

5、然后你就可以看到序列比對的結(jié)果了，紅色箭頭標(biāo)示的地方就是序列不一致的地方。

序列比對可以揭示哪些序列特征，可開展哪些方面的分析。

序列比對通過比較生物分子序列，發(fā)現(xiàn)它們的相似性，找出序列之間共同的區(qū)域，同時(shí)辨別序列之間的差異，從而揭示生物序列的功能、結(jié)構(gòu)和進(jìn)化的信息。最常見的比對是蛋白質(zhì)序列之間或核酸序列之間的兩兩比對，通過比較兩條序列之間的相似區(qū)域和保守性位點(diǎn)，尋找二者可能的分子進(jìn)化關(guān)系。還可以對多條蛋白質(zhì)或核酸序列同時(shí)進(jìn)行比較，尋找這些有進(jìn)化關(guān)系的序列之間共同的保守區(qū)域、位點(diǎn)和概型，從而探索導(dǎo)致它們產(chǎn)生共同功能的序列模式。此外，還可以通過比較蛋白質(zhì)序列和核酸序列相比來探索核酸序列可能的表達(dá)框架；把蛋白質(zhì)序列與已知三維結(jié)構(gòu)信息的蛋白質(zhì)相比，從而獲得蛋白質(zhì)折疊類型的信息。

DNA序列比對中的同源性、相似性、一致性三個(gè)概念有何聯(lián)系與區(qū)別？

相似性和同源性：相似性（similarity）和同源性( homology)是兩個(gè)完全不同的概念。同源序列是指從某一共同祖先經(jīng)過趨異進(jìn)化而形成的不同序列。相似性是指序列比對過程中檢測序列和目標(biāo)序列之間相同堿基或氨基酸殘基序列所占比例的大小。當(dāng)兩條序列同源時(shí)，它們的氨基酸或核苷酸序列通常有顯著的一致性（identity）。如果兩條序列有一個(gè)共同的進(jìn)化祖先，那么它們是同源的。這里不存在同源性（homology）的程度問題，兩條序列要么是同源的要么是不同源的。